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財政部臺北市國稅局表示，邇來常接獲民眾詢問，到藥局買藥時藥局該不該開立統一發票？
該局說明，依加值型及非加值型營業稅法第1條規定，在中華民國境內銷售貨物或勞務者，應依法課徵營業稅。又依同法第3條第2項但書及同法施行細則第6條規定，藥師（藥劑生）提供之專業性勞務非屬營業稅課稅範圍。針對有關藥師、藥劑生親自主持之藥局，課徵營業稅及開立發票規定說明如下：
一、藥局如專營藥品調劑、供應業務，未兼營藥品或其他貨物銷售業務者，免辦營業登記，免課徵營業稅；惟應按其收入核定主持藥師、藥劑生之執行業務所得，依法課徵綜合所得稅。
二、藥局除經營藥品調劑、供應業務外，如兼營藥品或其他貨物銷售業務者，應依法辦理營業登記，其屬經營藥品調劑、供應業務之收入，應核定主持藥師、藥劑生之執行業務所得，依法課徵綜合所得稅；其屬銷售藥品或其他貨物之收入，應依法課徵營業稅，如每月營業額超過20萬元，則需開立統一發票。
三、藥局依醫師處方箋調劑藥品向健保局領取之調劑費及藥品費，係屬藥局經營藥品調劑、供應業務之收入，為主持藥師、藥劑生之執行業務所得，依法課徵綜合所得稅，尚無課徵營業稅及開立統一發票問題。
四、藥局專營或兼營藥品調劑、供應業務，依前開規定免徵營業稅者，應保存醫師處方箋及帳載等相關證明文件與資料，以供稽徵機關查核，否則，仍應依法課徵營業稅。
　　該局呼籲，營業人應自行檢視本身屬何種經營型態，如有非屬藥品調劑、供應業務者，其收入即應依規定開立統一發票並報繳營業稅，避免日後遭到查獲除補稅外尚須處罰。