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財政部臺北市國稅局表示，景氣逐漸復甦，員工在雇主的要求下，配合加班形成常態，因此有員工來電詢問，加班費是否免稅？抑或要列入薪資所得，課徵綜合所得稅？
該局說明，員工如為雇主之目的執行職務而支領之加班費不超過規定標準者，可免納所得稅；但加班費如超過規定標準的話，超過部分要列入薪資所得，合併申報綜合所得稅。但有的公司是不管有無加班或加班時數多少，一律按月定額發給加班費，則其性質是屬於津貼性質，應併同薪資所得扣繳稅款，不得適用免稅的規定。
該局進一步說明，何謂「規定標準」呢？就公司營利事業員工而言，依勞動基準法第24條規定「延長工作時間之工資」及第32條規定「每月平日延長工作總時數」限度內支領之加班費，可免納所得稅。不分男工、女工，雇主延長勞工之工作時間連同正常工作時間，一日不得超過12小時，延長工作時間，一個月不得超過46小時。如須在國定假日、例假日、特別休假日執行職務支領的加班費，其金額符合前述規定標準範圍以內者，免納所得稅。
舉例說明，一男工如果在一個月內正常工作天中已加班49小時，46小時的部分依規定可以免稅，另外超過的3個小時加班費則要併入薪資所得課稅，如在國定假日又加班8小時，這8個小時可以不包括在「每月平日延長工作總時數」內，因此只要他領的加班費金額符合勞動基準法第24條規定標準者，這8個小時的加班費仍然免稅。
該局指出，上班日發生颱風，員工為雇主之目的，於已經主管機關公布該地區為「放假日」，仍然照常執行職務而支領之加班費，其金額符合規定標準範圍以內者，免納所得稅，其加班時數不計入「每月平日延長工作總時數」內。
該局提醒納稅義務人，瞭解加班費的課稅規定後，就可以自行檢視以維自身權益.